Seine Mutter, Ludwika, war Malerin. Vater, Wiesław Kotański, Professor für Japanstudien an der Universität Warschau. Ab 1960 studierte er Psychologie an der Universität Warschau. Während seines Studiums war er in der Young Educators Movement aktiv, die sich um Waisenkinder und Jugendliche kümmerte, die von sozialen Pathologien betroffen waren. Nach seinem Abschluss arbeitete er als Therapeut in einer psychiatrischen Klinik in Ul. Nieder in Warschau. Er arbeitete mit dem Sozialausschuss für die Bekämpfung des Alkoholismus zusammen und war auch an der Gründung der Sobriety-Bewegung beteiligt. 1974 nahm er eine Stelle in der Psychiatrischen Klinik in Garwolin an, wo sich eine Abteilung für Drogenabhängige befand (die damals aus ideologischen Gründen in Polen als nicht existent angesehen wurde). Da die traditionellen Behandlungsmethoden nicht zu positiven Ergebnissen führen, begann er als therapeutische Gemeinschaft zu arbeiten, die sich an den Erfahrungen von Synanon orientierte - der ersten von Charles Dederich gegründeten Organisation der Welt, die darauf abzielt, Drogenabhängige mit dieser Methode zu behandeln. Obwohl Monar erst 1981 als Verein eingetragen wurde, wurde das erste Zentrum am 15. Oktober 1978 in Głoskowo bei Garwolin gegründet. Es wurde in einem verlassenen und teilweise ruinierten Haus eingerichtet. Marek Kotański begann dort mit einer Patientengruppe aus dem Krankenhaus in Garwolin zu arbeiten. Die Auswirkungen erwiesen sich als viel besser als erwartet. Derzeit gibt es über 157 Zentren von Monar. Ab 1986 war er Mitglied des beratenden Rates beim Vorsitzenden des Staatsrates der Polnischen Volksrepublik Wojciech Jaruzelski. Er schloss sich ihrer Arbeit an, an der Menschen wie Krzysztof Skubiszewski und Władysław Siła-Nowicki teilnahmen. Er hoffte, dass der Rat als Ort für kollektive Psychotherapie dienen würde, und er würde eine bessere Kommunikation zwischen den Teilnehmern ermöglichen. Im Rahmen der Solidarni Plus Association organisierte er auch Siedlungen für Menschen, die von HIV- und AIDS-Patienten betroffen sind. In den Jahren 1985-1994 organisierte er die Kette der reinen Herzen, in der sich Hunderttausende junge Menschen zu einer Kette zusammenschlossen, die die Ostsee mit der Tatra verbindet und sich in der Idee des Humanitarismus vereint. Es gab auch viele Konzerte von Pure Hearts, an denen Tausende von Menschen teilnahmen. Ohne Erfolg kandidierte er 1989 für den Senat der Polnischen Volksrepublik 1989 als unabhängiger Kandidat in der Region Warschau. 1993 gründete er Markot - die Abfahrt der Obdachlosigkeit (100 Zentren für Obdachlose, alleinerziehende Mütter mit Kindern, Behinderte und todkranke Menschen). Er entwickelte auch ein Hilfesystem für Personen, die das Gefängnis verlassen haben und seit 1994 tätig sind. Im Jahr 2002 initiierte er zusammen mit seinen Freunden (siehe: Bolesław Śliwicki) Kommunalwahlen für Jugend- und soziale Aktivitäten unter dem Banner der Herzbewegung. Die erfolgreich organisierte Gliwice Heart Movement erhielt kein Mandat bei der Stadtverwaltung. Er starb am 19. August 2002 im Bielański-Krankenhaus in Warschau an den Folgen eines Autounfalls in Nowy Dwór Mazowiecki.
Seit 2002 werden Benefizkonzerte organisiert. Kotan's Day - Gönnen Sie sich andere und widmen Sie sich der Erinnerung an Marek Kotański. Im Jahr 2006 gründeten junge Menschen des Łódźer Monaru-Zentrums in Ozorkow eine Hochleistungs-Fußballmannschaft, die KOTAN genannt wird. Das Wappen des Clubs zeigt das Profil von Marek Kotański.